Основу сюжета фильма составляют поиски источника молодости, предпринятые одновременно монархами Испании и Англии и пиратом Эдвардом Тичем по прозвищу Чёрная Борода, в то время как героя предыдущих частей фильма, капитана Джека Воробья, интересуют поиски собственного корабля — «Чёрной жемчужины». Фильм начинается с того, как двое моряков достают из воды старика, у которого обнаруживают документы с корабля Хуана Понсе де Леона. Вместе с документами и стариком моряки отправляются в Кадис во дворец короля Фердинанда VI.

Древняя Греция, 1200 год до нашей эры. Царица, поддавшаяся похоти Зевса, рожает сына, который согласно пророчеству свергнет тиранию царя и восстановит мир на земле. Однако принц Геракл ничего не знает о своём настоящем происхождении и своей судьбе. Он хочет только одного любви царевны Крита Гебы, которая была обещана в жёны его собственному брату. Когда Геракл узнаёт о своём великом предназначении, он должен сделать выбор бежать со своей настоящей любовью или выполнить свою судьбу и стать настоящим героем своего времени.

Молодому и успешному риелтору Павлу, провернувшему немало полулегальных сделок, необходимо получить доверенность на куплю-продажу старинного поместья. А для этого втереться в доверие к владелице недвижимости, одинокой старушке, доживающей свои дни в родовом гнезде. Разработав хитрый план, риелтор-аферист получает заветную бумагу и начинает готовить поместье к продаже, празднуя очередную победу. Но не тут-то было! В отлаженный ход событий вмешиваются высшие силы.

Прошло пять лет с тех пор, как агенты организации по слежению за пришельцами предотвратили межгалактическую катастрофу. Агент Кей с тех пор вернулся к комфорту гражданской жизни, пока агент Джей продолжал работать на Людей в чёрном — тайную организацию по слежению и контролю инопланетян на Земле. Расследуя обычное с виду преступление, Джей обнаруживает дьявольский заговор Серлины, злого кайлотианского чудовища, принявшего форму модели дамского белья.

Действие фильма происходит в США в двух временных линиях: в 2012 году и в 1969 году. В события вовлечено агентство «Люди в чёрном», секретная организация, ведающая делами пришельцев на Земле. Межгалактический уголовник Борис Животное, представитель вымершей расы боглодитов, инопланетных захватчиков, уничтожавших целые миры, с помощью своей сообщницы Лилли сбегает из Лунной тюрьмы Луномакс и намерен вернуться в прошлое, чтобы убить агента Кея .

XXI век. Четверо друзей занимаются раскопками под Санкт-Петербургом в местах боевых действий Великой Отечественной войны с коммерческой целью за найденные награды и оружие дают хорошие деньги. Организатор — бывший студент исторического факультета Сергей Филатов по кличке Борман .Он хорошо знает историю Великой Отечественной войны и места боёв, где можно поживиться. Помощник Бормана растаман по прозвищу Спирт . Двое других участников группы Чуха и Череп . Череп НС-скинхед с татуировкой на плече в виде стилизованного символа свастики. А Чуха друг Бормана с детского сада.

В будущем человечество обнаружило способ путешествовать быстрее света и построило колонии на тысячах планет. Но даже ресурсы Вселенной начинают сокращаться, поэтому пятьсот миллиардов людей начинают долгое путешествие обратно домой. Желание населить Землю перерастает в войну, пока универсальное правительство коалиций не объявляет Землю священной, и, таким образом недоступной.

В мире, разрушенном человеческим грехом, Ной получает божественную миссию: построить ковчег, чтобы спасти свою семью и пару животных каждого вида от предстоящего потопа.

Тысячелетия прошли с тех пор, как Бёр, отец Одина, победил Темных Эльфов во главе с Малекитом, который стремился вернуть Вселенную к ее исходному состоянию, стерев все Девять миров силой Эфира, превращающего материю в тёмную материю. После разгрома Малекит, бросив свою армию, скрылся, а Бёр велел зарыть Эфир так глубоко, как только возможно.

Ведущий теленовостей Пэт Новак рассказывает жителям Америки о том, что дроны США используются во всех уголках мира, для поддержания порядка, кроме самой Америки. В прямом эфире показывают операцию по зачистке в Тегеране. Полицейский Алекс Мёрфи рассказывает шефу полиции Карен Дин об операции по поимке опасного преступника Антоана Вэллона, в ходе которой был ранен его напарник Джэк Льюис. Шеф просит Алекса не действовать самому и уверяет, что займётся этим делом сама.

Проходит шесть лет после взрыва рейса N 180 и пять лет после аварии на трассе 23. Старшеклассница Венди Кристенсен и её друзья идут развлечься в парк аттракционов. Ребята решают прокатиться на американских горках «Полёт Дьявола». Венди не хотела идти на горки, но её парень Джейсон уговорил её. Пока идет подготовка к запуску аттракциона, к Венди приходит жуткое видение: в результате утечки в гидравлике, вагончики сойдут с рельс и все пассажиры погибнут. Очнувшись от страшного видения, Венди понимает что катастрофа вот-вот произойдёт.